Para las aplicaciones de la ciencia de materiales, los microscopios estereoscópicos equipados para la epi-fluorescencia se utilizan para observar las estructuras de material o para determinar los elementos químicos de sustancias con la ayuda de fluorocromos.
Cuando se expone a la llamada "luz de excitación", algunos materiales o elementos químicos absorben la radiación de la luz de excitación y emite luz en otra longitud de onda visible. Esto hace posible la observación de las estructuras de material diferente para identificar la presencia o ausencia de ciertas sustancias químicas.
Los microscopios estereoscópicos Euromex de epi-fluorescencia se construyen con una fuente de iluminación incidente basada en una lámpara de vapor de mercurio 100W, de fuente de luz de mercurio de 100 W de vapor y uno o varios bloques de filtros de fluorescencia compuestos por un filtro de excitación, un espejo dicroico y un filtro de emisión