Le choix de l'éclairage approprié est essentiel pour le microscope stéréoscopique et il est principalement déterminé par la transparence de l'objet
Dans le cas d'objets non transparents, on utilisera un éclairage incident (épiscopique). Un éclairage incident peut être coaxial ou sous un certain angle. Avec des objets transparents ou partiellement transparents, on peut utiliser un éclairage transmis ou diascopique. Parfois, en utilisant l'éclairage incident et transmis en même temps on peut améliorer les résultats afin de révéler certains détails
La composition de la géométrie, de la structure de surface et la composition de l’échantillon sont aussi des paramètres importants pour choisir la meilleure solution d'éclairage
Euromex propose différentes sources de lumière froide (halogène ou LED), des bras en fibres optiques droits ou annulaires, des éclairages annulaires à LED ou fluorescents